提速近10倍!基于深度学习的全基因组选择新方法来了******
近日,中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用,将助力深度学习在全基因组选择中的应用,为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物(Molecular Plant)》上。
全基因组选择作为新一代育种技术,通过构建预测模型,根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择,从而缩短育种世代间隔,加快育种进程,节约成本,推动现代育种向精准化和高效化方向发展。
统计模型作为全基因组选择的核心,极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型,难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。
相较于传统模型,非线性模型(如深度网络神经)具备分析复杂非加性效应的能力,人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机,深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。
该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料,通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。
与其他五种主流预测方法相比,该方法有以下优点: 可以利用多组学数据开展全基因组预测;算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构,可以有效降低模型错误率,提高运行速度;预测精度稳健,在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当,在大规模数据集上预测优势更加明显;计算时间与传统方法相近,比已有深度学习方法提速近10倍;超参数调整对用户更加友好。
该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。
学术支持
中国农业科学院作物科学研究所
记者
宋雅娟
中新网评《狂飙》:有安欣才能有安心******
昨晚,开年爆剧《狂飙》迎来大结局,随着高启强、赵立冬、何黎明等落网,京海市黑恶势力与保护伞终被铲除,大快人心。安欣、李响、徐忠们在风浪中为理想坚守到底,屡遭挫折毫不动摇,最终守护了京海的蓝天。
回顾这段追剧历程,我们每天为刺激的剧情紧张上头,更为张译、张颂文、李一桐、李健等全体演员的用心演绎拍手叫好,相信看到最后,每个人都会为安欣心疼,更被他的“轴”和坚韧感动。
在为正义狂飙的路上,安欣从意气风发到熬出白发,他将巨大的痛苦藏在心中,却始终没有隐藏自己的善良和正义。“这么多年,我从来没想过自己的后路。”安欣拉起警戒线一步步逼退高启强的戏,也成为被大家反复观看的经典名场面。
徐忠说过,“像安欣这样的警察,常常被嘲笑不够聪明,不会变通。如果以升官发财为标准,安欣确实不够精明,但他的品质,恰恰是政法队伍最需要的。”
随着《狂飙》的热播,安欣的现实原型也被越来越多的观众们看到,他的“轴”并不是虚构,“生扑”炸弹、搏斗中被钢钎刺穿上臂、扫黑警察牺牲战友全体喊“到”……这些剧情在现实生活中都能找到原型。
安欣,安全的安,欣欣向荣的欣。《狂飙》导演说,正因为有安欣这样的人,大家才有希望。他们用“轴”牢牢守住公平的底线,用善良拉住那些差点下坠的手,剧里,每个人都在大喊安欣,走出剧情,我们更要对身边的“安欣”们道声感谢,因为他们的理想,就是让老百姓安心。
《狂飙》收官了,生活还在继续。无数个“安欣”,仍守护在我们的身后,为正义拼命“狂飙”。向一直在坚守的扫黑英雄们致敬!有“安欣”守护“理想”,才能有大家的安心!(中新网微博)
(文图:赵筱尘 巫邓炎)